Thường diễn ra từ ngày mùng 6 tháng Giêng âm lịch và kéo dài đến hết tháng 3 âm lịch. Lễ hội chùa Bái Đính không chỉ mang giá trị tâm linh sâu sắc, mà lễ hội được tổ chức nhằm góp phần bảo tồn và phát huy các giá trị văn hoá, lịch sử tuyền thống của dân tộc, tưởng nhớ các vị anh hùng đã có công với quê hương, đất nước. Đây là cơ hội để du khách khám phá lịch sử của vùng đất cố đô Hoa Lư, cũng như chiêm ngưỡng vẻ đẹp của kiến trúc Phật giáo của một trong những ngôi chùa lớn nhất Đông Nam Á.

Lễ hội chùa Bái Đính gồm 2 phần Lễ và Hội. Phần lễ gồm các nghi thức thắp hương thờ Phật, tưởng nhớ công đức Thánh Nguyễn Minh Không, lễ tết thần Cao Sơn và chầu thánh Mẫu Thượng Ngàn. Lễ hội được bắt đầu bằng nghi thức rước kiệu mang bài vị Thần Cao Sơn, Đức Thánh Nguyễn và Bà Chúa Thượng Ngàn.

Phần hội sẽ có các hoạt động mang tính chất văn hoá tâm linh như: rước kiệu, viết thư pháp, các trò chơi dân gian; thăm thú hang động, vãn cảnh chùa, thưởng thức nghệ thuật hát Chèo, Xẩm, Ca trù đất Cố Đô, tổ chức các hoạt động triển lãm tranh ảnh văn hoá nghệ thuật giới thiệu về chùa Bái Đính, Khu du lịch sinh thái Tràng An. Đại biểu, tăng ni và du khách cùng tham gia nghi lễ thả chim phóng sinh, cầu nguyện cho quốc thái dân an, mưa thuận gió hoà, đất nước phồn vinh, ấm no, hạnh phúc.

Không chỉ là một sự kiện văn hoá tâm linh, lễ hội chùa Bái Đính mà còn là nơi hội tụ những giá trị truyền thống, lịch sử và tinh thần thiêng liêng của dân tộc Việt Nam. Đến với lễ hội, mỗi người không chỉ tìm thấy sự bình an trong tâm hồn mà còn cảm nhận được sự gắn kết giữa quá khứ và hiện tại, giữa con người với đất trời, là cơ hội để mỗi người nhìn lại bản thân, trân trọng những giá trị tốt đẹp và tiếp nối tinh thần hướng thiện.

Lễ hội chùa Bái Đính chính là “nét đẹp ngàn năm” của vùng đất cố đô, như một ngọn đèn soi sáng giữa dòng chảy thời gian, soi rọi những nét đẹp trường tồn của văn hoá Việt.